本学大学院医学研究科博士課程は、医学を人間に関する総合科学と位置づけ、不断前進する医学的知識・技術を理解、実践し、更にはこれを自ら更新する能力を修学する教育・研究の場です。ここでは、医師・医学者を科学者のみならず感性豊かな教養人として育成することを目途としています。即ち学是「仁」の心を兼ね備えた医学・医療の指導者・実践者を国際的レベルで育成する教育研究の拠点であります。

医学研究科では、APRIN eラーニングプログラム (eAPRIN)　に機関登録をしています。文部科学省の公正な研究活動の推進に向けた「研究活動の不正行為への対応のガイドライン」においては、研究倫理教育が必須とされる予定であることから、大学院生もこのｅラーニング講座の受講が必須となりました。

標準修業年限（4年）在籍して、体系的教育コース（コアプログラム）及び専門領域における研究指導コース（専門プログラム）合計で30単位以上を修得し、査読のある国際的学術誌に筆頭著者として公表する原著論文についての学位審査及び最終試験に合格した者に対し、博士（医学）の学位を授与します。